การตรวจ PET/CT เป็นการตรวจที่ให้ความไวสูงมาก ค วามผิดปกติที่เกิดจากภาวะอื่นโดยเฉพาะอย่างยิ่ง กลุ่มโรคติดเชื้อเรื้อรังซึ่งพบได้บ่อยในประเทศเขตร้อน ยกตัวอย่างเช่น วัณโรค ก็อาจตรวจพบได้ด้วย PET/CT ผลที่เกิดขึ้นทำให้ ความแม่นยำของการแปลผลมะเร็งของ PET/CT ลดลง

เนื้องอกที่เป็นมะเร็งส่วนใหญ่ สามารถตรวจพบได้ด้วย PET/CT โดยการใช้สาร FDG แต่ยังมีเนื้อมะเร็งบางชนิด ที่ไม่มีความผิดปกติของการเผาผลาญน้ำตาลชนิดนี้ จึงทำให้มะเร็งดังกล่าวไม่สามารถตรวจได้ด้วยการฉีดสาร FDG ที่ใช้เป็นประจำ ตัวอย่างเช่น มะเร็งต่อมลูกหมาก มะเร็งสมองบางชนิด เป็นต้น อย่างไรก็ตามมะเร็งเหล่านั้นสามารถตรวจพบได้ด้วยสารเภสัชรังสีตัวอื่น

ยังมีปัจจัยที่มีผลต่อการตรวจพบมะเร็งอื่นๆ อีก ได้แก่ ขนาดของเนื้องอก PET/CT สามารถตรวจพบขนาดของรอยโรคที่เล็กสุด คือ 5-7 mm. นอกจากนี้ จำนวนของเซลล์มะเร็งที่อยู่ในรอยโรคนั้นก็มีส่วนสำคัญ ถ้าจำนวนเซลล์มะเร็งน้อย หรือ มะเร็งที่สร้างสารจำพวก mucin จะไม่สามารถตรวจพบได้ด้วย PET/CT

สารเภสัชรังสีที่ชื่อ FDG อ ยู่ในร่างกายของผู้ป่วยจะถูกขับออกทางปัสสาวะและสามารถจับอยู่ในผนังของสำไส ้ได้ ดังนั้น FDG เหล่านี้จะบดบังรอยโรคในทางเดินปัสสาวะและรอยโรคเล็กๆ ในลำไส้ก็อาจถูกบดบังได้เช่นเดียวกัน

PET/CT แสดงผลการตรวจที่ร่างกายเฉพาะในเวลานั้น แต่ร่างกายมนุษย์มีการเปลี่ยนแปลงตลอดเวลา ดังนั้นเนื้องอกที่เกิดขึ้นในอนาคตอาจตรวจไม่พบในขณะนั้นก็ได้ และในปัจจุบันก็ยังไม่มีข้อแนะนำชัดเจน ในเรื่องระยะเวลาของการตรวจซ้ำ ในกรณีที่ผลตรวจ PET เป็นผลลบ

จากการศึกษา การตรวจคัดกรองมะเร็งในประเทศญี่ปุ่น ทำโดย Dr.Yasuda ในปี 1994-2002 ซ ึ่งทำในคนปกติ จำนวน 6147 คน พบว่า มีมะเร็งในกลุ่มคนดังกล่าวประมาณ 2.1% PET/CT สามารถตรวจพบมะเร็งชนิดต่างๆได้ 53% ซึ่งมะเร็งที่ไม่สามารถตรวจพบ จะเป็นมะเร็งในกลุ่มทางเดินปัสสาวะ มะเร็งต่อมลูกหมาก มะเร็งตับ มะเร็งขนาดเล็กที่สุดที่ตรวจพบคือ 6 mm.

การศึกษาล่าสุดซึ่งตีพิมพ์ในปี 2006 โดย Dr.Idem ซ ึ่งรวบรวมตั้งแต่ปี 1994-2005 โดยมีจำนวน9357 คน พบว่าในจำนวนนี้ มีผู้ป่วยมะเร็ง 3.16% โดย PET/CT ใม่สามารถตรวจพบมะเร็งในทางเดินปัสสาวะเป็นหลัก

ในปัจจุบันยังไม่มีข้อบ่งชี้ทางการแพทย์อย่างชัดเจน ว ่าการคัดกรองมะเร็งด้วย PET/CT จะให้ประโยชน์สูงสุดสำหรับผู้ป่วย แต่เมื่อพิจารณาถึงหลักการของการตรวจนี้ ซึ่งเป็นการถ่ายภาพในระดับเซลจึงทำให้ PET/CT อาจถูกเลือกใช้ให้เป็นวิธีการคัดกรองมะเร็งขั้นพื้นฐานในอนาคตอันใกล้นี้