อีกความสัมพันธ์หนึ่งของไทย กับกัมพูชา นั่นคือปัญหาพรมแดนทางทะเล เนื่องจากเกาะกูด ในสมัยรัชกาลที่๕ ก็เข้าไปเกี่ยวข้องกับกรณีพิพาทระหว่างไทย ฝรั่งเศส โดยที่กัมพูชาเป็นอาณานิคมของฝรั่งเศสและฝรั่งเศสต้องการขยายดินแดนเข้ามาในไทย จนเกิดกรณีปากน้ำ รศ ๑๑๒ ฝรั่งเศสเข้าครอบครองจันทบุรีและตราด จนเกิดสนธิสัญญาแลกเปลี่ยนดินแดนโดยกำหนดให้ไทยต้องสูญเสีย เสียมราฐ ศรีโสภณและเกาะกง นอกจากนี้ยังกำหนดเส้นอาณาเขตทางบกที่ติดชายฝั่งโดยเล็งจากยอดเขาสูงสุดของเกาะกูด ถึงสันเขาพนมกระวานเป็นเส้นสมมุติสำหรับกำหนดเขตแดนบริเวณชายฝั่งของสองประเทศ

กัมพูชาตีความว่าเส้นสมมุติดังกล่าวเป็นพรมแดนทางทะเลด้วย ไทยตีความว่าเป็นเส้นกำหนดเขตทางบกเท่่านั้น นี่คือปัญหาทับซ้อนและส่งผลถึงประโยชน์ทางการประมง และทรัพยากรใต้ทะเล ซึ่งถือว่ามูลค่าสูงยิ่ง

ความสัมพันธ์ในเชิงนิเวศน์วิทยา ของเกาะกูดก็น่าสนใจไม่แพ้กัน ข้าพเจ้าติดใจตั้งแต่การมีชุมชนหิ่งห้อย ให้เราได้ชมกัน

หรือแม้กระทั่งป่าแสมและโกงกางโดยรอบเกาะ รวมทั้งความหลากหลายแห่งพืชพรรณ ตั้งแต่ ต้นบุก สวนมะพร้าว

ต้นพรวด และสาปเสือ..เดินไปทางไหนก็มีความหลากหลายอยู่

นั่นแสดงว่า ระบบนิเวศน์ของที่นี่ยังอุดมอยู่

ต้นพรวด

ต้นไคล้ย้อย

สาปเสือ

ระบบนิเวศน์ที่ยังมีความสมบูรณ์ของเกาะกูด คือเสน่ห์ของเกาะแห่งนี้

หาดตะเภาในวันที่ต้องลาจาก

นักล่าภาพ ปฏิบัติการกันก่อนเดินทางกลับ